Филогенетический анализ некодирующих последовательностей

Филогенетический анализ некодирующих последовательностей фокусируется на выявлении эволюционных связей и консервации вне кодирующих участков генома — главная задача здесь выбрать корректные выравнивания и модель эволюции, учитывающие неравномерную скорость замены и вставки/делеции.

Что входит в работу

• сбор и предобработка последовательностей: выбор референсов, удаление низкокачественных участков и фильтрация повторов;
• множественное выравнивание с учётом инделов и структурных особенностей некодирующих регионов;
• подбор модели нуклеотидной эволюции и оценка поддержек ветвей с помощью бутстрэпов или баесовских методов;
• построение и визуализация деревьев, анализ консервативных участков и расчёт расстояний;
• интерпретация результатов с учётом биологического контекста и возможных артефактов выравнивания.

На что смотрит преподаватель

Оценивают корректность источников данных, обоснование методов выравнивания и моделей, полноту описания процедур и корректность интерпретации деревьев; важно показать понимание ограничений анализа и возможных ошибок в результатах.

Мы подготавливаем структурированный разбор темы по методичке: обоснование выбора инструментов, список использованных методов и краткая интерпретация выводов от автора, который знаком с филогенетическими подходами. В результате вы получаете текст по теме с возможностью бесплатных правок по замечаниям до 21 дня — опишите задание в заявке, чтобы получить расчёт.